Большинство хитридиомицетов внутриклеточные паразиты. Они паразитируют на высших растениях, водорослях, других водных грибах, беспозвоночных животных. Значительно меньшая часть хитридиомицетов ведет сапрофитный образ жизни, поселяясь на ветвях, листьях, плодах деревьев, трупах насекомых и других животных, оказавшихся в воде.
Вегетативное тело у многих внутриклеточных паразитов представлено голой плазменной массой, которая всей своей поверхностью впитывает питательные вещества из клетки хозяина плазмодием. Более высокоорганизованные формы характеризуются зачаточным мицелием. Основа клеточной стенки хитридиомицетов – хитин (до 60%). Бесполое размножение осуществляется зооспорами различного строения с одним жгутиком. Способы полового воспроизведения разнообразны. У некоторых видов зооспоры при определенных условиях функционируют как гаметы, у других сливаются сами особи (хологамия), у третьих – сливаются гаметы, одинаковые (изогамия) или различающиеся по размерам, а иногда и по окраске и активности движения (гетерогамия).
К этому классу относится возбудитель «черной ножки» капустной рассады – ольпидий капустный (Olpidium brassicae). Растения заражаются в парниках, особенно при избыточной влажности почвы и загущенных посевах, в фазе семядольных или первых настоящих листьев.
Стебель пораженного растения в области корневой шейки темнеет, утончается, нередко загнивает, а само растение поникает и гибнет. Заражение происходит с помощью одножгутиковых зооспор, которые проникают в клетки эпиблемы и первичной коры корня. В клетке зооспора теряет жгутики и становится плазмодием, который питается органическими веществами клетки. Через определенное время он покрывается оболочкой и преобразуется в шаровидный зооспорангий. Зрелые зооспоры выходят наружу через выводковую трубку спорангия, направленную к поверхности органа. К концу вегетационного периода зооспоры в перезревшем зооспорангии начинают функционировать как гаметы. Они сливаются попарно вне хозяина. Двужгутиковая зооспора, найдя в почве клетку хозяина, переливает в нее свое содержимое, а затем разрастается и покрывается толстой оболочкой. В таком виде зигота-циста переживает неблагоприятные условия. Весной зигота делиться мейозом и прорастает в зооспорангий.
Сходный жизненный цикл имеют и представители рода синхитриум, один из видов которого Synchytrium endobioticum вызывает очень опасное заболевание – рак картофеля. Заражение также происходит с помощью зооспор. Плазмодий грибы выделяет специфические вещества, которые стимулируют деление клеток, окружающих пораженные участки, при этом на клубнях появляются бугристые опухоли, напоминающие губку. Они разрастаются, часто превышая размеры клубня, чернеют и затем разрушаются. Потери урожая при этом могут превышать 50%. В настоящее время выведены сорта, устойчивые к этому заболеванию.