Вторичное строение корня начинает формироваться в зоне проведения благодаря появлению вторичных меристем камбия и феллогена.
Между первичной ксилемой и флоэмой в результате деления клеток возникает слой камбия, который соединяется с перициклом и образует непрерывное извилистое камбиальное кольцо. Внутрь кольца сплошными слоями откладывается вторичная ксилема (древесина), наружу - вторичная флоэма (луб). Элементов ксилемы откладывается больше, поэтому камбиальное кольцо перестает быть извилистым.
Боковые корни закладываются в перицикле против лучей протоксилемы. В результате деления клеток перицикла формируется небольшой меристематический бугорок, прикрытый корневым чехликом. Зачаток корешка растет и пробивается через кору материнского корня.
В большинстве деревянистых корней за началом формирования вторичных флоэмы и ксилемы обычно следует образование пробки, и пробковая ткань замещает эпидерму на этих частях растения, в качестве защитного покрова.
Одновременно с камбием клетки феллогена формируют перидерму (пробку). В корнях первый феллоген образуется за счёт делений клеток перицикла. Клетки пробки непроницаемы для воды и минеральных веществ, из-за чего ризодерма и первичная кора отмирают и сбрасываются.У большинства двудольных и голосеменных первая перидерма обычно появляется в течение первого вегетационного периода в тех частях корня, которые прекратили рост в длину.
К концу первого вегетационного периода в деревяннистом корне присутствуют следующие ткани (снаружи внутрь):
- остатки эпидермы и первичной коры,
- перидерма,
- перицикл,
- первичная флоэма (волокна и сдавленные тонкостенные клетки),
- вторичная флоэма,
- камбий,
- вторичная ксилема,
- первичная ксилема.